Tỉnh Thừa Thiên Huế có 158 hợp tác xã nông nghiệp, trong đó có 143 hợp tác xã chuyển đổi từ hợp tác xã cũ khi có Luật Hợp tác xã năm 1996, sau đó có sự hợp nhất 2 hợp tác xã Thuỷ Phương 1 và Thuỷ Phương 2 thành hợp tác xã Thuỷ Phương và 16 hợp tác xã thành lập mới sau khi có Luật hợp tác xã 1996.
Trong đó huyện Phong Điền có số hợp tác xã lớn nhất 42 hợp tác xã, tiếp đến là huyện Phú Lộc có 32 hợp tác xã, huyện Quảng Điền có 23 hợp tác xã, thị xã Hương Trà 22 hợp tác xã, huyện Phú Vang 17 hợp tác xã, thị xã Hương Thủy 11 hợp tác xã,  thành phố Huế 8, huyện A lưới 2 hợp tác xã và huyện Nam Đông chỉ có 1 hợp tác xã.
Quy mô hợp tác xã không đồng đều ở các địa phương, huyện Phong Điền có phần lớn là hợp tác xã cấp thôn, quy mô một hợp tác xã quản lý thấp hầu hết trên dưới 100 ha, thậm chí nhiều hợp tác xã có diện tích lúa dưới 50 ha trong lúc thị xã Hương Thủy hầu hết hợp tác xã có quy mô cấp xã.
- Năm 2014 tổng doanh thu của các hợp tác xã đạt gần 256,5 tỷ đồng (tăng hơn năm 2013 là 2,22 tỷ đồng tương ứng 0,7%).
- Tổng lãi 14,30 tỷ đồng tương ứng 11,6%. Bình quân một hợp tác xã lãi trên 91, 6 triệu đồng.
Một số địa phương có hiệu quả cao như: Thị xã Hương Thủy tổng lãi 3.831.036 ngàn đồng (b/q 348.276 ngàn đồng/1HTX), huyện Phú Vang tổng lãi 3.202.600 ngàn đồng (b/q 188.388 ngàn đồng/1HTX), thành phố Huế (lãi b/q 119.147 ngàn đồng/1HTX), huyện Quảng Điền (lãi b/q 65.875 ngàn đồng/1HTX)… Nhìn chung các hợp tác xã của các đơn vị đã tổ chức được nhiều loại hình dịch vụ và điều hành tốt trong sản xuất kinh doanh nên duy trì kết quả tương đối cao. Đại đa số các HTX này hội tụ đầy đủ các yếu tố như đội ngũ cán bộ được đào tạo cơ bản, phương án sản xuất kinh doanh rõ ràng, đa dạng loại hình sản xuất, kinh doanh, dịch vụ.    
Năm 2014 Chi cục Phát triển nông thôn đã tổ chức 07 lớp tập huấn tuyên truyền hướng dẫn Luật Hợp tác xã năm 2012 cho đội ngũ cán bộ quản lý hợp tác xã (chủ nhiệm, trưởng ban kiểm soát và kế toán trưởng của các hợp tác xã trên địa bàn của Tỉnh. Đồng thời đã tổ chức tập huấn, tuyên truyền 03 lớp do phòng Kế hoạch và Tài chính, phòng Nông nghiệp và PTNT các thị xã, huyện tổ chức.
Chi cục Phát triển nông thôn đã chỉ đạo, tư vấn, hỗ trợ các hợp tác xã xây dựng điều lệ, xác định lại cổ phần, thành viên tham gia hợp tác xã và hướng dẫn Đại hội chuyển đổi hoạt động theo Luật năm 2012.
Định hướng và những nhiệm vụ thực hiện trong những năm đến đối với hợp tác xã nông nghiệp
Đối với các đơn vị quản lý
- Phối hợp với chính quyền các cấp tăng cường công tác tuyên truyền, xác định rõ vai trò, trách nhiệm của các cấp ủy đảng, chính quyền, cán bộ trong phát triển kinh tế tập thể, kinh tế hợp tác xã theo Kết luận số 56KL/TW ngày 21/02/2012 của Bộ chính trị về đẩy mạnh thực hiện Nghị quyết trung ương V khóa IX về tiếp tục đổi mới, phát triển, nâng cao hiệu quả kinh tế tập thể và Kết luận số 97KL/TW ngày 15/5/1014 về một số chủ trương, giải pháp về tiếp tục thực hiện Nghị quyết Trung ương lần thứ VII khóa X về nông nghiệp - nông dân - nông thôn. Tổ chức quán triệt Quyết định số 2261/QĐ-TTg ngày 15/12/2014 của Thủ tướng Chính phủ phê duyệt chương trình hỗ trợ phát triển hợp tác xã giai đoạn 2015-2020.
- Tuyên truyền Luật hợp tác xã 2012 đến cán bộ, nhân dân, hướng dẫn  thành lập các hình thức kinh tế hợp tác ở các huyện, xã miền núi chưa có tổ chức kinh tế tập thể. Đồng thời đôn đốc các hợp tác xã chưa chuyển đổi hoạt động theo Luật năm 2012 khẩn trương chuyển theo đúng thời gian quy định của Luật.
- Rà soát lại các hợp tác xã tồn tại hình thức để chuyển đổi sang hình thức khác, sáp nhập hoặc giải thể để làm lành mạnh hóa hình thức kinh tế hợp tác xã.
- Rà soát, sắp xếp bộ máy quản lý Nhà nước chuyên ngành về kinh tế hợp tác và phát triển nông thôn từ Tỉnh đến Xã, đáp ứng yêu cầu và nhiệm vụ của phát triển kinh tế tập thể trong lĩnh vực nông nghiệp. Hoàn thành Kế hoạch đổi mới hợp tác xã theo Quyết định 710 của Bộ Nông nghiệp và PTNT.
- Tăng cường công tác hướng dẫn, kiểm tra về thi hành Luật hợp tác xã, các chính sách đối với phát triển kinh tế tập thể trong lĩnh vực nông nghiệp.
- Xây dựng mô hình hợp tác xã kiểu mới hoạt động theo Luật 2012 để làm hạt nhân nhân rộng trên địa bàn toàn Tỉnh.
- Tăng cường các hoạt động nghiên cứu khoa học, hợp tác quốc tế về phát triển hợp tác xã nông nghiệp.   
- Tổ chức rà soát đánh giá thực tế tình hình hoạt động của hợp tác xã trên địa bàn toàn Tỉnh theo tiêu chí xây dựng nông thôn mới.
- Tổ chức đào tạo, tập huấn cho cán bộ hợp tác xã cả lĩnh vực quản lý và chuyên môn nghiệp vụ. Nhất là cán bộ mới sau khi chuyển đổi, đăng ký lại hợp tác xã.
 Đối với hợp tác xã
- Tổ chức xây dựng điều lệ, đăng ký lại hợp tác xã, xây dựng phương án sản xuất, kinh doanh, dịch vụ của hợp tác xã theo Luật hợp tác xã sửa đổi năm 2012, trước mắt nên chọn những dịch vụ thiết yếu theo yêu cầu của hộ xã viên, phù hợp với khả năng của hợp tác xã, trên cơ sở bảo đảm hoạt động có hiệu quả.
 - Từng bước mở rộng đối tượng và phạm vi hoạt động, phấn đấu vươn lên làm dịch vụ tín dụng nội bộ, dịch vụ đầu ra; phát triển ngành nghề phi nông nghiệp nhằm tận dụng lao động tại hợp tác xã ngày càng tăng khi cơ giới được sử dụng rộng rãi trong quá trình sản xuất.
- Tích cực chuyển đổi cơ cấu cây trồng, vật nuôi; ứng dụng tiến bộ kỹ thuật, công nghệ cao vào sản xuất để không ngừng tăng năng suất cây trồng, vật nuôi, bảo đảm an toàn vệ sinh thực phẩm; hạ giá thành sản phẩm để tăng tính cạnh tranh;
- Liên kết với các doanh nghiệp để sản xuất gắn với tiêu thụ sản phẩm, đồng thời mở rộng thị trường tiêu thụ sản phẩm tăng thu nhập cho thành viên hợp tác xã.
- Giải quyết vốn cho các hợp tác xã hoạt động bằng cách thu vốn góp cổ phần, tích cực thu hồi nợ để bổ sung vốn lưu động, thu đủ vốn góp của xã viên còn thiếu cũng như vốn góp thêm của xã viên nơi có điều kiện theo sự nhất trí của Đại hội thành viên.
- Thực hiện hạch toán tiền công cho bộ máy quản lý theo Thông tư liên tịch số 74/2008/TTLT/BTC-BNN ngày 14 tháng 8 năm 2008 của Liên Bộ Tài chính và Nông nghiệp và PTNT. Hạn chế việc thu quỹ theo đầu sào để trả lương cho cán bộ hợp tác xã trái với quy định của Luật HTX.  
- Đối với những kế toán chưa qua đào tạo chuyên môn hoặc đã qua đào tạo nhưng không đúng ngành thì cần tham gia các lớp đào tạo dài hạn của Huyện và Tỉnh tổ chức.