UBND tỉnh giao Sở Nông nghiệp và Phát triển nông thôn chủ trì phối hợp Sở Tài chính và các ban ngành liên quan xây dựng dự toán kinh phí thực hiện hỗ trợ hàng năm, tổ chức tiếp nhận hồ sơ, thẩm định, báo cáo kết quả thẩm định trình UBND tỉnh ra quyết định hỗ trợ đúng trình tự thủ tục, đúng chính sách quy định.
Việc hỗ trợ cho các tàu cá đánh bắt xa bờ sẽ thực hiện theo quy định tại Nghị định 67 của Chính phủ về một số chính sách phát triển thủy sản. Ngoài ra, theo quyết định số 32/2016/QĐ-UBND ngày 23/5/2016 của UBND tỉnh Thừa Thiên Huế về việc ban hành Quy định một số chính sách khuyến khích phát triển sản xuất nông nghiệp thực hiện Tái cơ cấu ngành nông nghiệp tỉnh Thừa Thiên Huế giai đoạn 2016-2020, các dự án đầu tư cơ sở đóng mới, sửa chữa tàu cá đánh bắt xa bờ (có công suất từ 90CV trở lên) còn được ngân sách tỉnh Thừa Thiên Huế hỗ trợ 500 triệu đồng/cơ sở xây dựng mới và 250 triệu đồng/cơ sở nâng cấp, cải tạo để đầu tư xây dựng và mua sắm máy móc, trang thiết bị; hỗ trợ 50% chi phí đầu tư nghề mới, mua sắm ngư lưới cụ tăng năng lực đánh bắt thuỷ sản nhưng không quá 30 triệu đồng/tàu.