Để chủ động phòng chống hiệu quả các dịch bệnh ở gia súc, gia cầm và thủy sản nuôi, đồng thời sẵn sàng các phương án, nguồn nhân lực, vật tư, vắc xin, hóa chất để chủ động ứng phó các dịch bệnh nguy hiểm ở động vật, bệnh lây chung giữa người và động vật, hạn chế thấp nhất thiệt hại cho người và động vật nuôi, ngày 30/9/2015, UBND huyện Phú Lộc đã ban hành Kế hoạch số 267/KH-UBND về việc Phòng chống dịch bệnh ở gia súc, gia cầm, thủy sản nuôi trên địa bàn huyện Phú Lộc năm 2016, kinh phí dự kiến để thực hiện kế hoạch là 1.448.500.000 đồng, trong đó: Ngân sách huyện, xã: 195.500.000 đồng và Nhân dân đóng góp là 1.253.000.000 đồng.
Ngoài ra, huyện còn được Trung ương, UBND tỉnh hỗ trợ một số loại vắc xin như vắc xin Lở mồm long móng, dịch tả lợn, cúm gia cầm để tiêm phòng và hóa chất Iodine để thực hiện công tác vệ sinh, tiêu độc, khử trùng phòng chống dịch