1. Lãnh đạo chi cục
Chi cục Trưởng
Đồng chí Hồ Đính
Phó Chi cục trưởng
Đồng chí Lê Quý Thảo
2. Phòng Hành chính, tổng hợp
3. Phòng Trồng trọt
4. Phòng Bảo vệ thực vật
5. Các đơn vị trực thuộc Chi cục
- Trạm Kiểm dịch thực vật nội địa
- Trạm Kiểm dịch thực vật cửa khẩu