1. Quy hoạch về bảo vệ và khai thác nguồn lợi thủy sản (Điều 11): Nguồn lợi thủy sản là một loại tài nguyên có khả năng tái tạo, do đó để quản lý bền vững nguồn lợi thủy sản, Luật  quy định về quy hoạch bảo vệ và khai thác nguồn lợi thủy sản, đây là một trong những căn cứ để quản lý nguồn lợi thủy sản theo hướng bền vững, tổ chức khai thác thủy sản có trách nhiệm. Luật khẳng định căn cứ lập quy hoạch; nội dung quy hoạch; việc lập, phê duyệt, điều chỉnh, công bố quy hoạch.

2. Điều tra đánh giá nguồn lợi thủy sản (Điều 12): Kết quả điều tra là căn cứ quan trọng để quản lý hoạt động khai thác thủy sản theo hạn ngạch, bảo đảm khai thác thủy sản bền vững trên cơ sở trữ lượng nguồn lợi thủy sản. Định kỳ 05 năm thực hiện điều tra, đánh giá nguồn lợi thủy sản và môi trường sống của các loài thủy sản để căn cứ vào đó xác định hạn ngạch giấy phép khai thác cấp cho tàu cá nhằm bảo vệ và khai thác có hiệu quả, bền vững nguồn lợi thủy sản.

3. Khu bảo vệ nguồn lợi thủy sản (Điều 17): Luật không quy định về khu bảo tồn nguồn lợi thủy sản nội địa mà quy định khu bảo vệ nguồn lợi thủy sản và khẳng định khu bảo vệ nguồn lợi thủy sản là nơi cư trú, tập trung sinh sản, nơi thủy sản còn non tập trung sinh sống thường xuyên hoặc theo mùa của ít nhất một loài thủy sản thuộc Danh mục loài thủy sản nguy cấp, quý, hiếm hoặc loài thủy sản bản địa hoặc loài thủy sản di cư xuyên biên giới.

Chi tiết quy định về bảo vệ và phát triển nguồn lợi thủy sản được hướng dẫn cụ thể tại Thông tư số 19/2018/TT-BNNPTNT ngày 15/11/2018 của Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn.